關於文獻管理軟體 (bibliographical 或 citation managment) 我用過 EndNote 跟 Procite，後者可把一篇文獻歸到多個分類資料夾的功能後來 EndNote X 也具備了，就沒有繼續留戀。國外常提到的 RefWorks 我沒用過。另外 EndNote 也在 Web of Knowlede 裡有 EndNote Web, 我沒帳號，希望有人能補充。
以下的比較表的 EndNote 版本是基於我較熟的 EndNote X3 到 X4 (第 13, 14 版)，最新是 X5 (15th)，灌了還沒深究。 這兩個月的 Zotero 是 3.0b2。
關於 Zotero vs EndNote 的比較，網上資訊不少:
The Chronicle of Higher Education: Zotero vs EndNote (May 2011) 這篇把兩者長處摘要如下：
以下的比較表的 EndNote 版本是基於我較熟的 EndNote X3 到 X4 (第 13, 14 版)，最新是 X5 (15th)，灌了還沒深究。 這兩個月的 Zotero 是 3.0b2。
第二天就收到回應，這 windows-based 的觀點忽略了 Mac 的 Papers, Sente (先手), 補記一篇說明。
- Comparison of Citation Software at MIT -- Zotero vs RefWorks, EndNote 這篇夠新。裡面還有各軟體長短處短評。
- The Chronicle of Higher Education: Zotero vs EndNote (May 2011) 這篇分功能 P.K.，不過作者自承是 Zotero 的倡導者。
- University of Wisconsin-Madison 的 RefWorks/EndNote/Zotero Features Comparison 細節多。
- Wikipedia Comparison of Reference Management Software 也有很多細部的比較。
The Chronicle of Higher Education: Zotero vs EndNote (May 2011) 這篇把兩者長處摘要如下：
Zotero
- Cost
- Collecting sources online
- Syncing
- Speed, editing citations
- Sharing with others
- Creating sources from PDFs
EndNote
- Speed, overall
- Speed, inserting citations
- Speed, editing citations
- Finding full text
- Customizability
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